自从转基因食品问世以来，转基因食品对人体是否有害就一直是人们争论的热点话题。

2013年各种关于转基因的谣传如美国人不吃转基因、彩椒系转基因等在网上层出不穷，让消费者无法辨别真假，专家及国家政府部门就此做了大量澄清工作。

《食品安全法》自2009年6月实施以来，我国食品安全工作取得积极进展，食品安全形势总体稳中向好。时隔四年，伴随着食品安全形势的变化、食品安全监管体制的调整、食品产业和科技的发展，《食品安全法》已难以适应实际需要，国家启动了《食品安全法》的修订工作。

2013年1月食品安全国家标准GB28050-2011《预包装食品营养标签通则》正式实施，《通则》除规定了预包装食品的营养成分表的名称、顺序、表达单位及其修约规则外，还规定了食品标签上营养素的含量声称、比较声称和功能声称的具体要求。

2013年，婴幼儿奶粉安全事件频发。3月份“美素丽儿”奶粉被曝含有白色虫子之后，经调查发现，该公司存在非法购入未获进口食品卫生证书的欧标奶粉，篡改为进口美素丽儿奶粉批号进行销售等非法生产行为；8月份，“恒天然浓缩乳清蛋白检出肉毒梭菌”事件虽然最后被证实为乌龙事件，但事件初期在社会上引起了强烈反响；9月中旬，各大奶粉商争夺医院产房 "第一口奶"事件又将大众对婴幼儿奶粉的关注度提升至最高。

中国的食品安全问题已受到国内外的广泛关注。目前国内普遍认为，国家监管体制不完善是制约食品安全水平提高的主要原因之一。2013年3月15日，国务院发布了《国务院机构改革和职能转变方案》，其中食品安全监管机构改革是国家机构改革的重要组成部分。

2013年3月8日，有消费者投诉，其购买的农夫山泉饮用天然水中出现黑色不明物。4月10日，京华时报报道了农夫山泉标准不如自来水标准，截至5月7日，连续28天73个版面进行报道，京华时报创造了“一个媒体史上的奇迹”,引发了轩然大波。

2013年8月2日，恒天然集团发布消息称其2012年5月生产的3个批次浓缩乳清蛋白中检出肉毒杆菌，影响包括3个中国企业在内的8家客户。8月4日，经国家质检总局确认，杭州娃哈哈保健食品有限公司、可口可乐中国公司、多美滋婴幼儿食品有限公司，使用了可能受到肉毒杆菌污染的浓缩乳清蛋白粉。涉事企业均发表声明表示，对涉及的问题产品采取追溯、召回等措施。

有职业打假人称“每一部新法律催生一个新的打假领域”。2009年《食品安全法》生效，假一赔十的规定催生了大批食品职业打假人。2013年《预包装食品营养标签通则》的正式实施，又让不少职业打假人从关注的食品质量问题转向了食品的包装标识问题。

标准清理工作是2013年国家卫生计生委食品安全国家标准工作中的主要任务。根据《食品安全法》和国务院工作部署，2013年国家卫生计生委全面启动食品标准清理工作。

2013年2月，媒体曝光了湖南镉超标大米流向广东餐桌的事件后，镉大米再次引发公众关注。对此，广东省政府表示，“将查清湖南问题大米去向并向社会公布”.5月16日，广州市食药监局公布了2013年第一季度餐饮环节食品及相关产品的抽检结果，其中大米及米制品合格率最低，镉超标率达44.4%,同时官方还公布了涉事餐饮单位、涉事米制品企业等信息，又一次引发了人们对镉超标大米的担心。